Троя ІІ е разрушена и изгорена някъде около 2400 г. пр. н. е. Очевидно управляващата класа или даже по-скоро царското семейство не оцеляват и заровените съкровища дочакват археолозите.
Сменена е от Троя III, за която не можем много да кажем. Проблемът е, че при първоначалните си устремни разкопки Шлиман направо е е изгребал пластовете над Троя ІІ, особено III, IV и V.
Същественото е, че не се сменя културата. Същата Maritime culture. Традиционно се смяташе,че Троя III e период на пълен упадък, но според разкопките на Корфман не е точно така. В цитаделата живеят дори повече хора, има и нови сгради, като този мегарон:
